Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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