Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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