Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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