Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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