Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms