Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms