Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA2Q15596 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCOA2Q15596 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
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