Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NECTIN1Q15223 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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NECTIN1Q15223 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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NECTIN1Q15223 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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