Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK1Q15118 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDK1Q15118 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms