Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNIP1Q15025 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms