Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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