Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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