Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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