Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CAPSQ13938 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPSQ13938 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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