Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms