Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EIF4EBP1Q13541 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms