Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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C1orf61Q13536 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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