Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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