Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ERCC8Q13216 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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