Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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