Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms