Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TROQ12816 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TROQ12816 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TROQ12816 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TROQ12816 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TROQ12816 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TROQ12816 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
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