Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms