Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms