Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms