Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms