Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR1Q08345 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms