Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms