Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6Q03468 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms