Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC2Q02487 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms