Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms