Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF5P84085 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF5P84085 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARF5P84085 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARF5P84085 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARF5P84085 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF5P84085 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms