Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS28P62857 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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