Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms