Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EEFSECP57772 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EEFSECP57772 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms