Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV3P56539 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV3P56539 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV3P56539 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms