Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP7P55210 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP7P55210 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP7P55210 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP7P55210 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP7P55210 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP7P55210 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP7P55210 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP7P55210 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP7P55210 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms