Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AFDNP55196 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFDNP55196 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms