Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF135P52742 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms