Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLCP48506 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLCP48506 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms