Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms