Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms