Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTGER3P43115 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER3P43115 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms