Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTR1BP42025 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms