Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIP1P30622 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms