Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms