Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms