Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMLP26374 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMLP26374 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMLP26374 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMLP26374 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms