Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTX3P26022 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms