Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO1P25800 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms